Les vaccins interagissent avec le système immunitaire pour produire une réponse immunitaire similaire à celle produite par l’infection naturelle, mais ils ne provoquent pas la maladie et ne mettent pas la personne immunisée au risque de ses complications potentielles. En revanche, le prix à payer pour obtenir l'immunité par une infection naturelle pourrait être constitué par des déficiences cognitives dues à Haemophilus influenzae de type b (Hib), des malformations congénitales dues à la rubéole, un cancer du foie dû au virus de l'hépatite B ou le décès dû à une complication due à la rougeole.